Документы могут быть направлены:
- непосредственно заявителем через сервис на сайте ФНС или Портал государственных услуг;
- нотариусом через сервис на сайте ФНС или используя СМЭВ;
- МФЦ используя СМЭВ.
В любом случае, документы должны быть подписаны усиленной квалифицированной электронной подписью отправителя.
Кстати, на моей памяти это один из первых документов, зарегистрированных в Минюсте, в котором прописаны обязанности МИ ФНС России по ЦОД.